扫描电镜对于样品具有一定的要求：

1. 样品要尽可能干燥，若样品中含有水份，水分挥发会造成仓内真空度急剧下降，导致图像漂移，有白色条纹，甚至会影响灯丝寿命；
2. 热稳定性好，热稳定性差的样品往往在电子束的轰击下分解，释放气体和其他物质，污染电镜；
3. 导电性好，导电性差的样品会发生荷电效应，造成图像畸变，亮点亮线，像散等；
4. 不含强磁性，强磁性的样品观察一般会出现严重的像散，无法消去，磁性粉末如果粘的不牢固还可能会吸附到探头上，损害电镜。

生物样品具有含水量高、质地柔软、导电性差、容易变形等特点，因此采用扫描电镜观察生物样品时，必须对样品进行必要的处理。

生物样品通常指的是动物的体液、肌肉、毛发和一些组织器官，植物的根、茎、叶、果实等，以及各类微生物（细菌、真菌等）。生物样品的含水量高，一般为70%-80%，只有少数的样品，如一些花粉、毛发等可以直接放入扫描电镜中观察，大部分生物样品需要经过脱水干燥处理后才能进行观察。

生物样品制备的关键步骤是干燥，应尽量减少因水分蒸发导致的形变。大多数动植物， 特别是柔软的细胞和组织，在干燥时由于体积应力和表面张力的作用，容易发生明显的塌陷和变形，造成形貌失真。